1871年にボストン・レッドストッキングスとして創設された、長い歴史を持つ球団。1876年のナ･リーグ創設に参加し、1800年代には8度のリーグ優勝。1914年に初の世界一に輝いた。

　1948年に34年ぶりにリーグ優勝を果たし、1953年にミルウォーキーへ移転。1957年にはメジャーを代表する本塁打王ハンク・アーロンらの活躍で2度目のワールドシリーズ制覇を達成する。

　1966年にアトランタへ移転するとしばらくは低迷が続いたが、ボビー・コックス監督就任2年目の1991年に33年ぶりにリーグ優勝。1992年にもリーグ連覇を果たし、1995年にはグレグ・マダックス、ジョン・スモルツ、トム・グラビンの強力先発陣で3度目のワールドシリーズ制覇。打線も10年連続ゴールデングラブ賞に輝いた強打好守の中堅手アンドルー・ジョーンズや1990年のドラフト全体1位指名を受けた三塁手チッパー・ジョーンズらが骨格を形成し、ストライキで打ち切られた1994年を除いて1991年から2005年まで地区14連覇を達成するなど黄金期を築いた。だが、1996年と1999年のワールドシリーズではいずれもヤンキースに敗れた。

　2010年にはワイルドカードで進出したプレーオフで敗れたのち、21年間に渡ってチームを率いたコックス監督が勇退。チーム生え抜きのスター選手で通算2726安打を放ったチッパー・ジョーンズも2012年シーズンを最後に引退。2013年に就任3年目のフレディ・ゴンザレス監督の下、8年ぶりの地区優勝を果たすが、カージナルスにリーグ優勝を阻まれた。

　2014年から2年連続で負け越し、2016年も開幕から9連敗とつまずいて最下位で終了。シーズン前半にゴンザレス監督が解任され、ブライアン・スニットカー三塁ベースコーチが監督代行に就任した。新球場サントラスト・パークがオープンし、スニットカー監督体制となった2017 年はブランドン・フィリップスらを獲得してシーズンに臨むも、負け越し。さらに海外選手獲得に関する規律違反により、ジョン・コッポレラGMが永久追放処分を受けるなど、スキャンダルにも見舞われた。

　アレックス・アンソポロス氏がGMに就任した2018年はショーン・ニューカムやマイク・フォルタネビッチらの投手陣と主力のフレディ・フリーマンや新人王に輝いたロナルド・アクーナらの打撃陣がかみ合い、前評判を覆して5年ぶりの地区優勝。スニットカー監督が最優秀監督賞に輝いた。

2018年オフには2015年のア・リーグMVPの強打者ジョシュ・ドナルドソンを獲得。マイナー組織も充実し、新たな黄金期到来の可能性もある。