1969年の球団拡張でシアトル・パイロッツとして誕生し、当初はア・リーグに所属していた。しかし、わずか1年で経営に行き詰まり、のちにMLBコミッショナーとなるバド・セリグ氏が球団を買収してビールで有名なミルウォーキーへ移転し、醸造者を意味するブルワーズに改称した。

　ストライキによって前後期制となった1981年に後期優勝を果たし、1982年にはロビン・ヨーント、ポール・モリター、セシル・クーパー、ゴーマン・トーマスらの強力打線で初のリーグ優勝を果たした。1985年には江夏豊がキャンプに参加したが、メジャー入りは果たせず、そのままユニホームを脱いだ。

　球団拡張に伴って1998年からナ・リーグに編入。2001年には新球場がオープンするも低迷が続き、2002年から3年連続で地区最下位に沈んだ。ようやく低迷ムードを払拭したのは2008年。セシル・フィルダーとライアン・ブラウンの大砲コンビと、シーズン途中で獲得した左腕CC・サバシアらの活躍でワイルドカードでプレーオフに進出した。

　ザック・グリンキー、ショーン・マーカムら先発陣を補強して迎えた2011年はナ・リーグ編入後初となる地区優勝。しかし、リーグ優勝決定シリーズでカージナルスに敗れ、史上初の両リーグからのワールドシリーズ進出はならず、オフにはフィルダーを放出した。

　青木宣親が加入した2012年は、ブラウンが本塁打王、さらに2年連続のトリプルスリーを達成するも地区3位に終わり、2013年途中にはブラウンが薬物違反により出場停止処分を受けてチームも優勝争いに加われなかった。

　2015年、2016年は勝ち越せなかったが、2017年はドミンゴ・サンタナ、トラビス・ショー、エリク・テムズの30発トリオなどの活躍で地区2位に入り、クレイグ・カウンセル監督就任4年目の2018年にはオフの積極補強が成功して7年ぶりの地区制覇を果たした。

　2018年に移籍1年目で首位打者に輝き、リーグトップに2差の36本塁打、リーグトップに1差の110打点と、三冠王に迫る活躍を見せたクリスチャン・イエリチがMVPを受賞。35本塁打のヘスス・アギュラー、2年連続打率3割をマークしているロレンゾ・ケーン、チーム生え抜きのブラウンらなど、力のある打者がそろう。投手陣では新加入のジョーリス・チャシーンが先発陣の軸として15勝を挙げた。37年ぶりのリーグ制覇、そして初のワールドシリーズ制覇も可能な戦力は整っている。